El Grupo «A» estará formado por ocho equipos: S.D. Teucro, MMT Seguros Zamora, Zumosol ARS Palma del Río, FC. Barcelona «B» Lassa, BM. Alarcos Ciudad Real, Gijón Jovellanos, Handbol Bordils y R.G.C. Covadonga.
En el Grupo «B» quedarán agrupados ocho clubes: Cajasur Córdoba BM., Secin Group BM. Alcobendas, Viveros Herol BM. Nava, Amenabar ZKE, Cisne BM., Tolosa C.F. Eskubaloia, BMC y BM. Torrelavega.
Se sortearán los ocho conjuntos del Grupo «B» contra los ocho equipos del Grupo «A». La Primera Eliminatoria se jugará a partido único en la pista de los clubes del Grupo «B» durante el fin de semana del 1 o 2 de octubre.
En la Segunda Eliminatoria, los equipos participantes quedarán distribuidos de la siguiente forma: En el Grupo «C» estarán los ocho clubes clasificados entre la 9ª y la 14ª plaza en la Liga ASOBAL 2015/2016 además de los dos recién ascendidos a la máxima categoría: Fertiberia Puerto Sagunto, Bada Huesca, Liberbank Ciudad Encantada, BM. Guadalajara, BM. Sinfín, Ángel Ximénez Puente Genil, Recoletas Atlético Valladolid y Bidasoa Irún.
La Segunda Eliminatoria se jugará, el miércoles 26 de octubre, a partido único en casa de los equipos del Grupo «D». Se sortearán los ocho conjuntos del Grupo «D» contra los ocho del Grupo «C».